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2024-10-11 :: 3944 WordsAlphaFold
2024.10.9 David Baker、Demis Hassabis和John Jumper获得诺贝尔化学奖。
David Baker，1962年生。Harvard本科（1984）+UCB博士（1989）。华盛顿大学教授，美国科学院院士。
Demis Hassabis，1976年生，英国人。University of Cambridge (BA,1997)+University College London (PhD,2009)。英国皇家学会院士。DeepMind创始人&CEO。
John Jumper，1985年生。Vanderbilt University (BS,2007)+University of Chicago (PhD,2017)。DeepMind研究员。
https://mp.weixin.qq.com/s/xi_iIr6NdC3QOpjypx3pGg
AlphaGo之后，DeepMind重磅推出AlphaFold：基因序列预测蛋白质结构
https://zhuanlan.zhihu.com/p/415200429
解读AlphaFold优点和不足
https://www.zhihu.com/question/433443455
alphafold2的结果对于毕生研究蛋白质折叠问题的David Baker大牛是否是一个打击？
https://mp.weixin.qq.com/s/ZIw8NQfE8Spv1_RWknhipA
为什么说AlphaFold2足以改变全人类？
2016年秋天，许锦波在研究所召开了一个小型报告，邀请了芝加哥大学生物物理系合作者。其中有一位名叫John Jumper的年轻人，听完报告后决定转向深度学习方法。两个月后，他加入Deepmind，成为AlphaFold的团队带头人。
https://mp.weixin.qq.com/s/x0AnmUt5gRYx-ZCEAb1GAg
AI预测蛋白质结构第一人 许锦波：十年冷清终不渝，一个计算生物学的拓荒者
施一公从他开始评上院士，就有很多人质疑他的水平不够。他是做啥的？蛋白分子解析的，说的简单一点，就是用冷冻镜解析蛋白结构，这是个苦力活，用冷冻镜观察蛋白结构，从中分析出来一些东西，然后记录一下发篇Nature。这个东西有用吗？据说有用，但是现在还没用上。如果施一公能够把他研究的东西用上，比如说治疗某种疾病？甚至预防某种疾病？或者研发出某种药物等等，那么他当上院士就是当之无愧的，但可惜，目前还没什么用？而且这个理论也不是他提出来的，他只是应用者。
我记得有一个科学家说过一句话，具体是谁忘了：“中国科学家目前的状态就是，耗费大量的时间和金钱去验证国外的科学家（他们的国外导师）所提出的理论的正确性，为他们获得诺奖提供证据。”
施一公所做的也是这个工作，包括科大搞量子通信的潘建伟院士，他们所做的就是验证他们老师所提出的理论是否正确，并且应用这个理论做一些实验。
颜宁施一公的工作 = 手工织衣服
DeepMind的AlphaFold = 珍妮纺织机
这么几十年，所有的几千名结构生物学家才解析19万个蛋白质，DeepMind一年直接上亿，打破了原有的行业发展。
AlphaFold两个主要大佬Demis Hassabis和John Jumper在2023年获得豪华版诺奖：科学突破奖。
在ChemistryViews网站的一项调查显示，John Jumper也成为全球呼声最高的诺奖建议者名单的科学家，不过从历史来看，诺奖最短获奖时间是6年，因此AlphaFold目前只问世2年，还需要时间来验证其跨时代性。
DeepMind展示了工业化集团攻关的科研形式，相对于传统的一个教授（领主）带几个学生（佃农）的封建式科研形式的优越性。
至AlphaFold2问世之后，各国顶级投资人，政府机构，生物制药企业，原本拨给传统结构生物学的90%以上的经费，划拨给生物AI的实验室。
施一公自己想必也很清楚，用蛋白质结构设计药物这件事情早在半个世纪以前就被提出来了，目前市面上根据蛋白结构设计出来的药物数量为0。
八年前颜宁在解出葡萄糖转运蛋白GLUT1的结构以后说可以设计药物饿死癌细胞，后来又说要饿死疟原虫，八年过去了，药物在哪里呢？除了饿死被他们骗着学生物的学生，啥都饿不死吧……
施一公曾公开表示：压死骆驼的最后一根稻草，是鼓励科学家创业，后来自己却创立了一家制药公司。。。
10年前我读书的时候，我们院系有老师是做核酸检测的，因为那个时候不是啥显学，整个学科被11g抢资源抢的非常苦，简直是仇深似海。
解析晶体结构且只解析晶体结构，是一项复杂的简单工作，是一件体力劳动远多于脑力劳动、重复性极高且成功率不低的技术工作。既然选择了这样的工作，就不要再把自己包装成具有深邃思考的科学大家。
一句话概括施老师颜老师的Research：基于电镜技术的热门蛋白质三维结构的解析工作。
科学大家可能会有很多CNS，但有很多CNS的，不一定就是大科学家。
不料谷歌人工智能程序今年把已知的上亿种蛋白质的结构全破解了，大部分结果和用实验获得的一样好，以后只会越来越好，而且开源谁都能用。于是颜宁的专业就悲剧了，当然不会马上失业，但没前途是肯定的。而她除了解析蛋白结构又不会干别的，没法转行做功能生物学研究，毅然回国当学官、学商是最佳选择。
2000起基本每三年就有诺贝尔化学奖颁给结构生物学成果（2003离子通道，2006真核生物转录，2009核糖体结构，2012 G蛋白偶联受体），自从十年前冷冻电镜成熟运用后一次都没有再发给结构生物学研究，虽然近十年有大量之前无法搞定的重要蛋白/复合物结构都被解出来了。
alphafold不止对结构生物学领域起了很大的影响，还有分子对接领域，这个领域是纯计算的领域，因为同属于计算领域，可以说alphafold快完全干掉了传统的分子对接方法。有个在领域的德国教授私下说，他现在也没什么办法，都这么大年龄了，自己做了一辈子传统方法，也不可能再转去学和做深度学习。然后我就在想，我作为年轻人，根本不会想这些，总觉得自己能随时跟上时代，也不需要太大投入成本，但是人是抵不过岁月和成本的。
https://www.zhihu.com/answer/2739900394
如何看待颜宁宣布即将辞去普林斯顿大学教职，全职回国，出任深圳医学科学院创始院长？
https://www.zhihu.com/answer/2737553223
为什么现在网络上对施一公的风评变得这么差？
日本=
三神器是日本自传说时代流传下的宝物，它们分别是八咫镜、八尺琼勾玉和天丛云剑。
楠木正成战至最后一人，天皇连个追授都没有。楠木正成一个铁血忠臣，最后官位也只是从五位上和泉守。。。
七生报国从五位，犯上作乱大将军。
一至三位的属于高官，只有正，从之分；四阶开始，在正从内还分正上，正下，从上，从下四阶，正大于从，上大于下。
https://zhuanlan.zhihu.com/p/347357535
要当上日本天皇，拢共分几步？
洪武二年二月大明正式派遣杨载一行出使日本，气势满满，诏书上赫然写着：“诏书到日，如臣，奉表来庭；不臣，则修兵自固，永安境土，一应天修。如必为寇盗，朕当命舟扬帆诸岛，捕获其徒，直抵其国，缚其王”。
平心而论，倭寇确实猖狂，每年攻掠山东等沿海各州县，杀人放火，掠走百姓。明廷措词严厉，胁以兵威，本不为过。但明太祖却寄托于一味空口震慑，而根本没有武力上的后手准备，这种嘴炮外交结果，堂堂大明王朝白白被小日本啪啪啪的打脸。
主持九州政局的日本怀良亲王一看诏书便勃然大怒，野蛮的大开杀戒，将明朝使团除正使杨载、从使吴文华之外，全部斩杀！杨、吴被踢进监狱足足蹲了三个月，然后灰溜溜被驱逐出境。
七十二剑圣闯南京
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明朝真的比汉唐还要强盛吗？
三浦知良（Kazuyoshi Miura），1967年2月26日出生。2021年1月11日，横滨FC官方宣布与即将年满54岁的三浦知良再续约1年。
2016年5月23日，日本自卫队在北海道进行演习，此次演习的内容是弹药车遭到突然袭击时的对应。
演习双方使用的应该均为空包弹，但当从弹药车下车的自卫队员还击时，射出的却是真正的子弹，两名担任假想敌的自卫队员当即中弹倒地。
这次事件的责任在于负责发放弹药的人填错了单据，所以该领空包弹却领来了真子弹。
空包弹与实弹的弹头外观差别很大，重量也不一样。而自卫队装弹时竟然毫无察觉，可见严重缺乏经验。
最神奇的是，七个人使用89式自动步枪近距离向二人连续射击，打了将近八十枪，只有三枪命中而且没有打中要害。
日本江户时期武士封刀官家封剑，出来一大票剑术流派，什么松山直心流，古川圆心流，柳生新阴流。。。
幕末时期天下大乱，十几年就互相砍的只剩个北辰一刀流——现在剑道的祖宗。
https://www.zhihu.com/question/378070378
为什么中国100多种功夫流派，却搞不过泰国的泰拳？
说日本前首相菅义伟出身农民家庭，其实他父亲是满铁的特务，回老家后成为雇佣40多个农民的草莓种植大户，甚至不能说是小地主了。而且他们家没准还有其他资产，只是草莓种植大户的名声更响而已。
清末民国，北京八大胡同里面都有婊子格格，你认为小日本能够避免了。
你多花点钱还能在战前嫖到华族大小姐呢。
https://www.zhihu.com/question/9089183007
在战前的日本，一位平民出身的男生能光明正大的跟一名华族出身的大小姐交往吗？
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