COVID19 » 新冠肺炎（五）——病毒变异
2021-05-07 :: 5050 Words口罩（续）
3M公司的全称是明尼苏达矿务及制造业公司（Minnesota Mining and Manufacturing Company）。
https://mp.weixin.qq.com/s/wE69bNC7DicO6kSWhsfq2A
全球新冠确诊破200万，我们为什么比以往更需要3M？
https://mp.weixin.qq.com/s/Fkcbb-4LC_NsVJHCM-zRWQ
3M：世界上最不务正业公司——不只是口罩，好像哪里都离不开他！芯片制造也需要3M！
https://mp.weixin.qq.com/s/IVmgIp-LC6JiqfyCfXBJhg
口罩惊险史，听说内衣也可以“救急”？
https://mp.weixin.qq.com/s/WoQyr__tUBJ6HQrj3lnZuw
一图彻底了解怎么戴口罩！国家卫健委图解《不同人群预防新型冠状病毒感染口罩选择与使用技术指引》
https://mp.weixin.qq.com/s/lekdAyT0woQGwSO-xDSAMA
“疫不容辞” 这些电子厂“转型”口罩厂
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中国能生产多少口罩？解析从石油到医用口罩的制造流程
https://cj.sina.com.cn/articles/view/1650111241/625ab30901900p4r1
为什么口罩还是不好买？原来……
https://mp.weixin.qq.com/s/2LMnpJtSvO0KEDZ3GBtrog
为什么全国口罩日产量超1亿个，你却连1个都买不到？看完我惊了…
https://mp.weixin.qq.com/s/pSYJizQDQP_T2-krWPGUoA
疫情下的口罩“疯狂制造”：物料飚涨40倍, 3天回本“印钞机”
https://mp.weixin.qq.com/s/AjSjXgrKug6XpfUhmQX0kA
75天疫情产生260000吨医疗垃圾，去哪了？谁赚了？
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被英国首相点名后，戴森承诺造15000台呼吸机
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一张图告诉你：全球离“口罩自由”还有多远？
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抗疫重器呼吸机原理浅析
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N95之父华裔科学家Peter Tsai教你如何正确戴口罩
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全球疯抢的呼吸机，其产业链啥样？
https://wxn.qq.com/cmsid/TEC2020041800124100
供应断链卡脖呼吸机：核心零部件靠进口订单排到8月
https://mp.weixin.qq.com/s/tLljo8q-1eybDIk7CLQiSA
滴~37℃（温度计、额温枪、红外线测温仪，它们都是怎么测量体温的呢？）
https://mp.weixin.qq.com/s/SwYQFBv5lnej0g08bsBF1A
“英伟达呼吸机”开源：计算机架构大师打造，成本暴减98%，黄仁勋点赞
病毒变异
变异毒株的信息可搜寻以下网站：
https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
Tracking SARS-CoV-2 variants。这是WHO的官方网站
https://nextstrain.org/
该站跟踪各种病原的演进
https://outbreak.info/
这是来自Scripps Research的几位科学家创办的COVID-19专题站。Scripps Research是美国最大的私立非营利性的生物医学研究机构，成立于1924年。
https://cov-lineages.org/lineage_list.html
变种列表
PANGO命名法：
A和B表示武汉最早测序获得的2个原始株序列。由A系演化来的病毒的第一个分支被命名为A.1，第二个为A.2，以此类推；由A.1系演化来的病毒的第一个分支被命名为A.1.1系，第二个为A.1.2系，以此类推。B系同理。
当分支进化到第4阶时，就会以新字母开头。以一个具体的例子来说明，B.1.1.1.1被写作C.1，这里C就代表了B.1.1.1。
当新字母再次达到4阶分支的时候，命名将再次以同样的方式获得新字母。以一个具体的例子来说明。BF.7实际上是BA.5.2.1.7在达到4阶分支时的缩写（其中BF即BA.5.2.1），而BA.5.2.1.7又可以进一步扩写为B.1.1.529.5.2.1.7（其中BA即B.1.1.529）。
重组株不直接来源于A和B所演化的分支，可由两个距离较远的分支重组构成，为作区别，以字母X开头命名重组株。
https://www.zhihu.com/question/566190005
奥密克戎发现至今一年多了，为什么没有新的大变异？
大概在年初，新冠发生过一次重要的变异，就是D614G，在最早武汉上传的病毒序列中，这个位置的氨基酸编码是天冬氨酸(Asparagine,缩写为D)，也就是D614，而后来该位置发生了变异，氨基酸变成了甘氨酸（Glycine，缩写为G）。而变异后的结果就是这个突变株获得了更大的生存优势，更容易感染。
https://www.zhihu.com/question/26658191
南方汉族中Y染色体的相同率较高，线粒体DNA的相同率很低，是否说明北方汉族对南方男性进行过灭族屠杀？
https://mp.weixin.qq.com/s/TE7sPT-8sAyzsV7vPWYmtA
南非新冠病毒变体快速传播，哪些值得注意？
https://www.zhihu.com/question/435655677
新冠病毒在英国变异后传播力高出70%，这该怎么防范？变种病毒会导致更高死亡率吗？
https://mp.weixin.qq.com/s/C8FF1OevQbsAtGFKJgN1jA
令英国“大惊失色”的新冠病毒变异，是怎么回事？
https://mp.weixin.qq.com/s/JUTXnFZ1z9lCw93EljKcIA
俄罗斯女子体内的新冠病毒出现了18种变异？
https://www.zhihu.com/question/442576779
英国发现的新冠病毒变种再次发生突变，影响如何？
https://www.sohu.com/a/463192238_162758
专家释疑：印度变异新冠病毒为何让人口鼻流血？
https://mp.weixin.qq.com/s/QCANG1e86-JSsnKbyMXYRw
“反季节爆发”才是印度当前疫情最可怕的特点
https://mp.weixin.qq.com/s/MNRHzK0sz65U_QGGMYNe-A
“双重突变” 的新冠病毒，对印度疫情恶化影响几何？
https://zhuanlan.zhihu.com/p/383389024
也许，最可怕的VOC并不是B.1.617.2
https://www.zhihu.com/question/466493389
尼泊尔发现新冠变种毒株Delta的新突变，传播速度或更快，将对全球疫情进展带来哪些影响？
https://mp.weixin.qq.com/s/g9gPLEN6R02F49eRGGSuAA
来势汹汹：新冠Delta突变株是什么，我们该如何应对？
https://mp.weixin.qq.com/s/o7Eq7xoxqM_fOlS9HiZ_OA
新冠大流行，哪些关键突变株值得关注？
事实上，美国人嘴从来都不把门的。
他们经常把B.1.1.7叫做British variant或者Kent variant；
经常把P.1叫做Brazilian variant；
经常把B.1.1.138叫做Nigerian variant；
甚至经常把B.1.429叫做Califonia variant，经常把B.1.526叫做New York variant。
新的变异毒株叫做AY.1。最早是在尼泊尔珠峰大本营紧急下撤的感染者身上发现的。
所以英国佬给它取了个文艺范儿的外号，叫做“登山家变异株”（mountaineers variant）。
体会一下美国队的板凳深度：
https://www.zhihu.com/question/464038841
为什么美国疫情最严重，但却鲜有变异病毒的报道？
其实吧，19个变异点位真没啥稀奇的……
比如说啊，快要销声匿迹的B.1.616，它有29个变异位点。
英国发现的某个连名字都没资格拥有的variant，有28个变异位点。
意大利那不勒斯某个同样无名无姓的variant有25个变异位点；
美国纽约已经灭绝快一个月的B.1.604有24个变异位点。
都混得挺惨……
而且，就算S基因上有多重“危险”变异位点，也不一定就能变身毒王了……
最典型的例子是菲律宾的P.3，第一眼印象让人直呼好家伙，这尼玛是人间凶器集合。但现在回头一看，似乎也不是太能打的样子…
还有英国的AV.1，卖相也很恐怖，实际就是一匹废柴。
反之，S基因变异位点不起眼的家伙里面，却不乏牛鼻的。比如印度的B.1.618。
https://www.zhihu.com/answer/1893818645
如何看待中非传出的新冠病毒？
当初英国人拿赛默飞的PCR试剂盒测B.1.1.7，这货可以识别B.1.1.7的S基因69-70缺失突变特征（S:DEL69-70），因此省去了又贵又慢又娇气的全基因组测序步骤；
然后机智的耶鲁研究人员表示，他们发现，DEL3675–3677这个缺失突变，刚好是三种VOC共有的，于是他们开发出一种PCR试剂盒，可以针对ORF1a:DEL3675–3677进行识别。他们认为这样就能一次性搞定当时市面上三种VOC。
结果呢，机智的耶鲁研究人员又一次被病毒调戏了。这个缺失突变，它几乎就是市面上各大高危毒株的标配，C.37当然也不例外。
所以可以合理推测，但凡拿耶鲁这个PCR测出来的P.1流行率，都有水分，里面混了不知道多少C.37（以及其他毒株）。
delta快速取代原有流行毒株本来就是正常情况。
没有发生这种快速取代的那些少数例外，可能反而有大问题。
delta进入巴西，delta被挤没了……
delta进入秘鲁，delta又被挤没了……
delta进入智利，delta再次全军覆没……
delta进入阿根廷，delta欲哭无泪……
delta进入埃及，delta（可能）还是被挤没了……
delta进入博茨瓦纳，流行率死活没法过半（然而隔壁南非和纳米比亚早已陷落）
就以英国为例吧，大流行的头两年，基本上全年爆两到三波的样子；结果到了2022年，时间轴顿时调整到快进模式，6个月时间爆了三波可还行：
先是BA.1把Delta拍死在了沙滩上，
然后BA.2又把BA.1拍死在了沙滩上，
接下来BA.5马上就要把BA.2拍死在沙滩上……
现在BA.5都还风头正劲呢，下一波毒王的有力竞争者BA.2.75就已经早早就位。
Omicron正在演化成为人类专属病毒，作为代价，这货在小鼠/仓鼠这些动物身上的表现全面拉胯了。
https://mp.weixin.qq.com/s/AYluJy1DzLhPPreN6JTxeQ
新冠病毒是在越变越弱吗？
此前Alpha→Delta→BA.1→BA.2→BA.5，是非常清晰的单一毒株的依次更替。但今年9月份以来，这种规律已被打破，各类突变株百花齐放，上百种突变株在全球范围内同时出现，且每种突变株与BA.5相比都具有增长优势，这种新冠病毒进化现象是前所未有的。
新冠现在的免疫逃逸能力，毒力对半砍不会太影响它的传播；致死率十倍也不能构成有效选择压。潜伏期传播出去就不需要管宿主死活了。
天花传染力点满，致死率也没低到哪去，如果不是唯一短板，自身结构稳定没咋异变，也不至于和人类共存了几千年，堂堂甲类传染病被人类疫苗围剿没了。
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